醫(yī)院各部門的功能、設(shè)施和人員組成情況不同，產(chǎn)生污水的主要部門和設(shè)施有：診療室、化驗(yàn)室、病房、洗衣房、X光照像洗印、動物房、同位素治療診斷、手術(shù)室等排水。醫(yī)院行政管理和醫(yī)務(wù)人員排放的生活污水，食堂、單身宿舍、家屬宿舍排水。不同部門科室產(chǎn)生的污水成分和水量各不相同，如重金屬廢水、含油廢水、洗印廢水、放射性廢水等。而且不同性質(zhì)醫(yī)院產(chǎn)生的污水也有很大不同。醫(yī)院污水較一般生活污水排放情況復(fù)雜。

醫(yī)院污水主要來自診療室，病房，化驗(yàn)室，手術(shù)室，洗衣房，行政管理部門以及食堂，宿舍等排放的污水，主要污染物為有機(jī)污染物，病原微生物及病毒。醫(yī)院污水現(xiàn)在只經(jīng)格柵除渣及消毒后處理既排放，采用二氧化氯消毒劑，余氯和細(xì)菌學(xué)指標(biāo)能達(dá)標(biāo)，但有機(jī)物未被去除。為了全面達(dá)標(biāo)，醫(yī)院增加了曝氣生物濾池污水處理工藝處理污水?？紤]到該醫(yī)院污水處理廠占地有限以及水中含有一定量消毒劑的特點(diǎn)，決定采取負(fù)荷高，占地少，對進(jìn)水有機(jī)物濃度范圍適應(yīng)性錢的曝氣生物濾池工藝。

對于綜合醫(yī)院(不帶傳染病房)污水處理可采用“預(yù)處理→強(qiáng)化處理→消毒”的工藝。通過混凝沉淀(過濾)去除攜帶病毒、病菌的顆粒物，提高消毒效果并降低消毒劑的用量，從而避免消毒劑用量過大對環(huán)境產(chǎn)生的不良影響。 醫(yī)用污水處理的強(qiáng)化處理一般采用混凝沉淀、過濾、氣浮等工藝。過濾的固液分離方式需要反沖，操作管理較為復(fù)雜，而氣浮工藝中氣體釋放易導(dǎo)致二次污染。所以醫(yī)用污水中一般采用混凝沉淀工藝。

簡易生化處理工藝的流程為“沼氣凈化池→消毒”。沼氣凈化池分為固液分離區(qū)、厭氧濾池和沉淀過濾區(qū)。三區(qū)的主要功能分別為去除懸浮固體，吸附膠體和溶解性物質(zhì)，進(jìn)一步去除和降解有機(jī)污染物，后通過沉淀和過濾單元去除剩余懸浮物和降解有機(jī)污染物，出水質(zhì)量。所產(chǎn)生沼氣根據(jù)氣量大小作不同的處理，當(dāng)1m3污泥制取沼氣達(dá)15m3以上時，收集利用；當(dāng)1m3污泥制取沼氣不足15m3時，收集燃燒處理。 沼氣凈化池利用厭氧消化原理進(jìn)行固體有機(jī)物降解。沼氣凈化池的處理效率優(yōu)于腐化池和沼氣池，造價低、動力消耗低，管理簡單。 作為對于邊遠(yuǎn)山區(qū)、經(jīng)濟(jì)欠發(fā)達(dá)地區(qū)醫(yī)用處理的過渡措施，逐步實(shí)現(xiàn)二級處理或加強(qiáng)處理效果的處理。
醫(yī)療廢水來自醫(yī)院，含有大量的病原細(xì)菌、病毒和化學(xué)藥劑，需要特殊工藝處理。醫(yī)療污水主要是從醫(yī)院的診療室、化驗(yàn)室、病房、洗衣房、X片照相室和手術(shù)室等排放的污水，其污水來源及成分十分復(fù)雜。醫(yī)院污水中含有大量的病原細(xì)菌、病毒和化學(xué)藥劑，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染的特征。
根據(jù)國家環(huán)保總局的有關(guān)規(guī)定（國家環(huán)?？偩?醫(yī)院污水處理技術(shù)指南.2003.12（環(huán)發(fā)（2003）197號 ），將各類醫(yī)院按性質(zhì)分為綜合醫(yī)院和傳染病醫(yī)院兩類，與衛(wèi)生系統(tǒng)對醫(yī)院及醫(yī)療機(jī)構(gòu)的劃分方法有差別。其中傳染病醫(yī)院指傳染性疾病專科醫(yī)院和帶傳染病房的綜合醫(yī)院，綜合醫(yī)院為不帶傳染病房的綜合醫(yī)院和各類非傳染性疾病的?？漆t(yī)院。醫(yī)院污水凈化包括綜合醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)院、中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院、民族醫(yī)院和專科醫(yī)院（傳染病醫(yī)院（包括結(jié)核病院）、心血管病醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、口腔醫(yī)院、婦產(chǎn)科醫(yī)院和精神病醫(yī)院等等）各類醫(yī)院污水的處理，同時也包括療養(yǎng)院、康復(fù)醫(yī)院等其它醫(yī)療機(jī)構(gòu)和獸醫(yī)院的污水處理工程。