一種具有代表性的SBR工藝流程是： 通過格柵預(yù)處理的廢水，進(jìn)入集水井，由潛污泵提升進(jìn)入SBR反應(yīng)池，采用水流曝氣機充氧，處理后的水由排水管排出，剩余污泥靜壓后，由SBR 池排入污泥井，污泥作為肥料。
分批式操作： 時間分割的操作方式替代空間分割的操作方式，如SBR運行周期由進(jìn)水時間、反應(yīng)時間、沉淀時間、潷水時間、排泥時間和閑置時間，可以適當(dāng)靈活調(diào)節(jié)。

根據(jù)醫(yī)院性質(zhì)、規(guī)模和技術(shù)經(jīng)濟(jì)條件選擇消毒劑的種類。一般大中型醫(yī)院推薦使用液氯消毒工藝。在人口稠密的地方可采用次氯酸鈉消毒工藝。有條件的傳染病醫(yī)院可采用臭氧消毒工藝、小型醫(yī)院可采用氯片消毒工藝。四、放射性廢水、重金屬廢水及其他特殊廢水應(yīng)分別采取相應(yīng)的處理工藝，如放射性廢水采舊衰變貯存池處理，重金屬廢水可采用化學(xué)法或離子交換法處理。
醫(yī)院污水處理系統(tǒng)除了包括含菌污水的處理和消毒外，對其他各種特除排水根據(jù)需要還應(yīng)單處理，如含有重金屬的廢水，放射性廢水、含油廢水和洗印廢水等。重金屬廢水來自牙科治療和化驗室，含有汞，鉻等有害污染物，可用化學(xué)沉淀法或離子交換法處理。放射性廢水來自同位素治療和診斷。低濃度放射性廢水采用衰變池處理，或用化學(xué)共沉淀法、離子交換法處理。含油廢水來自廚房食堂，一般采用隔油池處理。洗印廢水來自照片洗印，含有銀、顯影劑、定影劑等有害物質(zhì)、含銀廢水可采用電解法回收銀，顯影劑可用化學(xué)氧化法處理。
醫(yī)院污水處理流程選擇是醫(yī)院污水處理設(shè)計的關(guān)鍵，流程是否合理將直接影響處理效果、工程投資、運行費用以及管理安全等問題。根據(jù)醫(yī)院污水排出口的標(biāo)高和所接入的城市下水道的標(biāo)高之差，確定是采用自排式還是提升式的消毒工藝。高差大于600mm即可以采用虹吸定比自排式消毒工藝，高差較小時可采用超聲波自動定比投氯消毒工藝或提升式定比投氯消毒工藝。
醫(yī)院廢水處理設(shè)備采用國際的生物處理工藝，在總結(jié)國內(nèi)外生活廢水處理裝置的運行經(jīng)驗的基礎(chǔ)上，結(jié)合自己的科研成果和工程實踐，設(shè)計出一種可地埋設(shè)置的成套有機廢水處理裝置，集去除BOD5、COD、NH3-N于一身，具有技術(shù)性能穩(wěn)定可靠、處理效果好、投資省、自動化運行、維護(hù)操作方便、不占地表面積、不需蓋房、不需采暖保溫等優(yōu)點。地面之上可種花種草，不影響周圍環(huán)境。
醫(yī)院污水處理過程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7～1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70～80%，進(jìn)行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學(xué)藥劑消毒、γ射線消毒等。加熱消毒的熱源通常為蒸汽、電能或生物能(高溫堆肥)，有的地區(qū)可以用太陽能。或者用焚燒法處理(見污泥焚燒)?；瘜W(xué)藥劑消毒可用漂白粉、石灰、氨水、液氯或苛性鈉等。用漂白粉或液氯時,有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時，污泥的pH值達(dá)到12后，保持半小時以上，效果好。