醫(yī)院污水處理是指處理醫(yī)院排放的污水的處理方式。醫(yī)院的污水，除一般生活污水外，還含有化學物質、放射性廢水和病原體。因此，經(jīng)過處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來的污水，須經(jīng)消毒后才可排放。無集中式污水處理設備的醫(yī)院，對有傳染性的糞便，單消毒使其無害化。常用消毒劑有二氧化氯、漂白粉、液氯、次氯酸鈉、臭氧。對含放射性同位素的污水，應按同位素處理要求處理。醫(yī)院污水在處理過程中，沉淀的污泥含有大量的細菌、病毒和寄生蟲卵，須經(jīng)消毒（常用熟石灰消毒）或高溫堆肥后方可用作肥料。

二氧化氯法：二氧化氯(ClO2)是一種強氧化劑，它在水中的溶解度是氯的5倍，其氧化能力是氯氣的215倍左右。它可以殺滅一切微生物，同時有效破壞水中的微量有機污染物，很好地氧化水中一些還原狀態(tài)的金屬離子。其大的優(yōu)點在于與腐殖質及有機物反應幾乎不產(chǎn)散性有機鹵化物，不生成并抑制生成有致癌作用的三鹵甲烷，也不與氨及氨基化合物反應，因此非常適合用于醫(yī)院污水處理。

醫(yī)院污水處理過程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7～1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70～80%，進行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學藥劑消毒、γ射線消毒等。加熱消毒的熱源通常為蒸汽、電能或生物能（高溫堆肥），有的地區(qū)可以用太陽能?；蛘哂梅贌ㄌ幚恚ㄒ娢勰喾贌??；瘜W藥劑消毒可用漂白粉、石灰、氨水、液氯或苛性鈉等。用漂白粉或液氯時,有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時，污泥的pH值達到12后，保持半小時以上，效果好。γ射線消毒可用60鈷或一些裂變產(chǎn)物的混合物作輻射源，輻射劑量為20～30萬倫琴。用此法對污泥消毒不產(chǎn)生臭氣，并可改善污泥的脫水和沉降性，但費用較高。
簡易生化處理工藝的流程為“沼氣凈化池→消毒”。沼氣凈化池分為固液分離區(qū)、厭氧濾池和沉淀過濾區(qū)。三區(qū)的主要功能分別為去除懸浮固體，吸附膠體和溶解性物質，進一步去除和降解有機污染物，后通過沉淀和過濾單元去除剩余懸浮物和降解有機污染物，出水質量。所產(chǎn)生沼氣根據(jù)氣量大小作不同的處理，當1m3污泥制取沼氣達15m3以上時，收集利用；當1m3污泥制取沼氣不足15m3時，收集燃燒處理。 沼氣凈化池利用厭氧消化原理進行固體有機物降解。沼氣凈化池的處理效率優(yōu)于腐化池和沼氣池，造價低、動力消耗低，管理簡單。 作為對于邊遠山區(qū)、經(jīng)濟欠發(fā)達地區(qū)醫(yī)用處理的過渡措施，逐步實現(xiàn)二級處理或加強處理效果的處理。
醫(yī)療廢水來自醫(yī)院，含有大量的病原細菌、病毒和化學藥劑，需要特殊工藝處理。醫(yī)療污水主要是從醫(yī)院的診療室、化驗室、病房、洗衣房、X片照相室和手術室等排放的污水，其污水來源及成分十分復雜。醫(yī)院污水中含有大量的病原細菌、病毒和化學藥劑，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染的特征。
根據(jù)國家環(huán)?？偩值挠嘘P規(guī)定（國家環(huán)?？偩?醫(yī)院污水處理技術指南.2003.12（環(huán)發(fā)（2003）197號 ），將各類醫(yī)院按性質分為綜合醫(yī)院和傳染病醫(yī)院兩類，與衛(wèi)生系統(tǒng)對醫(yī)院及醫(yī)療機構的劃分方法有差別。其中傳染病醫(yī)院指傳染性疾病?？漆t(yī)院和帶傳染病房的綜合醫(yī)院，綜合醫(yī)院為不帶傳染病房的綜合醫(yī)院和各類非傳染性疾病的?？漆t(yī)院。醫(yī)院污水凈化包括綜合醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)院、中西醫(yī)結合醫(yī)院、民族醫(yī)院和?？漆t(yī)院（傳染病醫(yī)院（包括結核病院）、心血管病醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、口腔醫(yī)院、婦產(chǎn)科醫(yī)院和精神病醫(yī)院等等）各類醫(yī)院污水的處理，同時也包括療養(yǎng)院、康復醫(yī)院等其它醫(yī)療機構和獸醫(yī)院的污水處理工程。