目前來看，高新技術服務費有兩種主要模式 一、固定金額 即：雙方就認定代辦一事談定一個固定的價格和確切的支付條件以及支付時間。使用這種支付方式的一般為老牌的正規(guī)機構。 二、比例提傭 即：企業(yè)通過認定，拿到相關補貼后。機構按照比例抽取一定的。至于比例，由雙方商定。實用此類支付方式的，一般為近幾年新成立的機構。因近年高企補貼大幅度提升。催生的新的機構和新的收費模式。

建立材料、工裝準備控制制度 財務部門在每月的月底處理完所有的研究開發(fā)項目的領料單、出庫單。財務部門和研發(fā)部門每月核對領料情況，財務部門作為研發(fā)費用記賬依據(jù)的原材料領用單經過研發(fā)部門有關負責人簽署。財務部門依據(jù)各研究開發(fā)項目的工裝準備費用單據(jù)計算各項目的工裝準備費用。

認定申請應提交的材料主要包括幾個部分： 1.認定申請書； 2. 企業(yè)營業(yè)執(zhí)照副本、稅務登記證（復印件）； 3. 知識產權證書（占許可合同）、生產批文，新產品或新技術（查新）材料、產品質量檢驗報告、省級以上科技計劃立項，以及其他相關材料； 4. 企業(yè)職工人數(shù)、學歷結構以及研發(fā)人員占企業(yè)職工的比例說明； 5. 經具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用情況表（實際年限不足三年的按實際經營年限），并附研究開發(fā)活動說明材料； 6. 經具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度的財務報表（含資產負債表、損益表、現(xiàn)金流量表，實際年限不足三年的按實際經營年限）以及技術性收入的情況表。 以上材料僅供參考，具體請以實際申請要求為準。 申請要點 1、6個軟件著作權或6個實用新型或1個發(fā)明。 2、企業(yè)需要提供三年內的12份銷售合同。 3、企業(yè)需要提供近三年內，每年的年度審計報告。近三年的研發(fā)費用專項審計報告，高新收入專項審計報告。 4、提供公司人員名單及對應的研發(fā)人員、科技人員、人員名單，并提供相應人員的明復印件、勞務合同（崗位及支撐，沒有就調整）、明復印件。 5、由技術人員配合調整技術材料，完善立項報告、研發(fā)文檔等。